经病毒污染的环境也带毒
对于公众关心的H7N9病毒的传播途径，方案中明确指出，具体途径可经唿吸道传播或密切接触感染禽类的分泌物或排泄物而获得感染;或通过接触病毒污染的环境传播至人;不排除有限的非持续的人传人。
对比上一版诊疗方案中提及的“经唿吸道传播，也可通过密切接触感染的禽类分泌物或排泄物，或直接接触病毒感染”，市疾控中心相关负责人解释，新版中将“禽类分泌物或排泄物”概括为“病毒污染的环境”更为準确，因为H7N9病例确有摸过装有携带该病毒的禽类的笼子或者容器，甚至土壤、空气等大环境等继而被感染的情况，不仅仅是其分泌物或排泄物，这样定义将在提高人们自身防护意识的同时，对卫生疾控部门的后期现场清除和消杀具有指导意义，更为全面具体。
何为“不排除有限的非持续的人传人”?上述负责人解释称，因从目前掌握的病例情况来看，H7N9病毒在人际间的传播确实是有限的，不是大规模的传播，加上“非持续的”则更能说明其传播性有限的特性，“目前来看，报告的病例都是个案，散发，且相对独立，没有看到持续的传染迹象”。同时，方案中称，目前已经在禽类及其分泌物或排泄物以及活禽市场环境标本中检测和分离到H7N9禽流感病毒，与人感染H7N9禽流感病毒高度同源。传染源可能为携带H7N9禽流感病毒的禽类。目前，大部分为散发病例，有个别家庭聚集发病现象，但尚无持续人际间传播的证据。
潜伏期缩短至3天至4天
方案中指出，根据流感的潜伏期及现有人感染H7N9禽流感病例的调查结果，潜伏期一般为3-4天。与此前“潜伏期一周”相比明显缩短。
北京市疾控中心相关负责人解释称，这是通过一年来积攒的病例得出的结论，去年初刚在我国亮相的H7N9病毒被按照甲流的潜伏期预估确定了潜伏期“一周”，但结合病例情况和流行病学史调查即可发现，一般在接触了H7N9禽流感病毒感染的环境后3至4天即会发病。同时，为了方便公众“对号入座”，方案中明确了H7N9病例的症状、体征和临床特点。患者一般表现为流感样症状，如发热、咳嗽、少痰，可伴有头痛、肌肉酸痛、腹泻等全身症状。重症患者病情发展迅速，多在发病3—7天出现重症肺炎，体温大多持续在39℃以上，出现唿吸困难，可伴有咯血痰。常快速进展为急性唿吸窘迫综合征、脓毒症、感染性休克，甚至多器官功能障碍，部分患者可出现胸腔积液等表现。
在对H7N9感染的高危人群定义上，新旧两版也有明显区别，旧版中为“在发病前1周内接触过禽类者，例如从事禽类养殖、贩运、销售、宰杀、加工业等人员”，新版中则为“在发病前1周内接触过禽类或者到过活禽市场者，特别是老年人”。
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